CleanDTR es un eficaz sistema basado en microesferas paramagnéticas, diseñado por CleanNA para eliminar los colorantes terminadores no incorporados de las reacciones de secuenciación Sanger. También puede utilizarse para CRISPR-Cas9. El proceso CleanDTR consta de tres sencillos pasos: unión, lavado y elución. Mientras el producto de secuenciación se une selectivamente a las partículas magnéticas, los colorantes, nucleótidos, sales y cebadores no incorporados se eliminan durante los lavados con etanol. Este principio permite la elución del producto de secuenciación Sanger puro en el tampón de elución elegido. El protocolo puede adaptarse a su actual estación de trabajo de manipulación de líquidos (por ejemplo, Beckman, Hamilton, Tecan, Caliper, Perkin Elmer, Agilent y Eppendorf) utilizando su protocolo actual, así como puede realizarse manualmente.
Ventajas
Largas longitudes de lectura de Phred 20 con un promedio de más de 800 bps
Tasas de aprobación superiores o iguales al 85
Eliminación eficaz de los contaminantes de la reacción de secuenciación
Reducción del uso de BigDye*, gracias al aumento de la intensidad media de la señal
Aplicaciones
Limpieza del producto de secuenciación para
Plataformas ABI y MegaBACE
Químicas soportadas
- BigDye* versiones 1.0, 1.1, 2.0, 3.0 y 3.1
- DYEnamic ET
* BigDye es una marca registrada de Applied Biosystems
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