los 2'-Deoxi-2'-fluoro-nucleósidos adoptan una conformación de azúcar tipo ARN, presumiblemente debido a la alta electronegatividad del flúor. Debido a esta conformación de azúcar, los dúplex de ARN (forma A) suelen ser termodinámicamente más estables que los dúplex de ADN (forma B). Como era de esperar, la adición de residuos de 2'-F-ARN a los oligodesoxinucleótidos aumenta progresivamente la estabilidad térmica de sus dúplex con ARN. La estabilización es aditiva en aproximadamente 2° por residuo. Esto se compara favorablemente con el 2'-OMe-ARN a alrededor de 1,5° y el ARN a 1,1° por residuo. Mientras tanto, la especificidad del par de bases permanece intacta.
los enlaces fosfodiéster del 2'-F-ARN no son resistentes a las nucleasas, aunque los enlaces fosforotioato correspondientes son muy resistentes. Los investigadores suelen diseñar oligonucleótidos antisentido para formar dúplex con el ARN, que luego son sustratos de la RNasa H. Los dúplex de 2'-F-ARN/ARN uniformemente modificados no son sustratos de la RNasa H. Sin embargo, es sencillo preparar oligonucleótidos quiméricos de fosforotioato de 2'-F-ARN/ARN que presentan una unión mejorada a la diana de ARN, son sustratos de la RNasa H y son altamente resistentes a las nucleasas.
Especificaciones
Química
Masa/peso molecular - 307,17
Almacenamiento y estabilidad
Condición de resuspensión -
- Centrifugar brevemente el tubo para recoger el precipitado en el fondo del tubo - Añadir un volumen adecuado del tampón recomendado (consultar la ficha técnica) - Dejar reposar el tubo unos minutos - Agitar el tubo en vórtex durante 15 segundos
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