Acerca de la secuenciación metagenómica de próxima generación
todo el proceso de mNGS incluye procedimientos de laboratorio húmedo y de laboratorio seco, los procedimientos de laboratorio húmedo incluyen: pretratamiento de la muestra, extracción de ácidos nucleicos, preparación de la biblioteca, cuantificación de la biblioteca, secuenciación. Se necesitarán diferentes reactivos para los procedimientos.
Los procedimientos de laboratorio seco incluyen el control de calidad de los datos de secuenciación, la comparación y el análisis, etc.
A lo largo de años de I+D, MatriDx ha lanzado kits de reactivos de agotamiento del huésped, kits de preparación de bibliotecas de ADN/ARN y kit de cuantificación de bibliotecas NGS.
Kit de reactivos de depleción del huésped
Aplicación
Este kit se utiliza para depletar el ADN del huésped de las muestras (incluyendo BALF, hidrotórax y ascitis, CSF, esputo, etc.), se ha verificado que este kit puede enriquecer eficazmente las bacterias, los hongos, los virus de ADN, la clamidia y el micoplasma en las muestras clínicas, puede mejorar en gran medida la sensibilidad de detección de mNGS.
Ventajas
Poco tiempo: consumo: el tiempo total es de unos 15 minutos (unas 2-4 horas para otros métodos)
Alta eficacia: La proporción de secuencias microbianas totales se incrementa en una media de 29,4 veces.
Ventajas
1. Aumento de la tasa de detección, reducción de la tasa de falsos negativos.
2. Aumento de la RPM, aumento de la credibilidad de la identificación.
3. Puede identificar especies e incluso subespecies.
Kit de preparación de bibliotecas de ADN/ARN
Aplicación
Este kit se utiliza para la extracción de ácidos nucleicos y la preparación de bibliotecas para los secuenciadores illumina, incluye la extracción de ADN/ARN, la transcripción inversa de ARN, la fragmentación de ADN/ARNc, la reparación de extremos A tailing, la ligadura de adaptadores, la purificación de la biblioteca.
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