El AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 es un ensayo de resecuenciación dirigida para la investigación de mutaciones somáticas en las regiones "hotspot" de 50 genes con asociaciones conocidas con el cáncer, identificadas en la base de datos Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC)1 . Entre sus principales características se incluyen:
Contenido de genes relevantes
Dirigido a ~2800 mutaciones COSMIC de 50 oncogenes y genes supresores de tumores
Flujo de trabajo rápido y optimizado
Prepare bibliotecas listas para secuenciación en un solo día a partir de tan solo 1 ng de muestras de alta calidad o 10 ng de muestras fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE)
Datos precisos
Detecte mutaciones somáticas de hasta un 5% de frecuencia alélica variante mediante análisis locales o basados en la nube
El panel Cancer HotSpot forma parte de un flujo de trabajo integrado que incluye la preparación de bibliotecas basada en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) AmpliSeq para Illumina, la tecnología de secuenciación de próxima generación (NGS) por síntesis (SBS) de Illumina y el análisis automatizado.
Este panel permite la detección altamente sensible de variantes en múltiples tipos de cáncer, incluyendo pulmón, colon, mama, ovario, melanoma y próstata. El panel listo para usar le ahorra el tiempo y el esfuerzo de identificar dianas, diseñar cebadores y optimizar paneles.
Especificaciones
Tiempo de ensayo - 5 horas (sólo preparación de bibliotecas; no incluye cuantificación de bibliotecas, normalización ni tiempo de agrupación)
Tipo de cáncer - Pan-cáncer, Tumor sólido
Especificaciones de contenido - Regiones activas de 50 genes con asociaciones conocidas con el cáncer
Descripción - Investigación mediante análisis somático de las regiones "hotspot" de 50 genes relacionados con el cáncer.
Tiempo práctico - < 1.5 hr
Cantidad de entrada - 1-100 ng (10 ng recomendados por pool)
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