aRNm-Seq con selección de poli(A)
Amplia gama de entrada de ARN total (de 1 ng a 1 μg)
Fácil flujo de trabajo todo en uno
Desde la selección de poli(A) hasta las bibliotecas listas para secuenciar en 5,5 horas
Identificadores moleculares únicos (UMI) incluidos
índices duales únicos (UDI) de 12 nt incluidos
El CORALL mRNA-Seq Library Prep Kit permite la generación rápida y rentable de bibliotecas con identificadores moleculares únicos (UMI) e índices duales únicos para los análisis de ARN poli(A) del transcriptoma completo utilizando las plataformas NGS de Illumina®.
Cobertura superior de extremo a extremo
La amplia cobertura de CORALL ofrece una mejor representación de los sitios iniciales y finales de los transcritos. La cobertura de las lecturas se analizó utilizando los controles ERCC spike-in, que presentan sitios de inicio y final de transcripción precisos y conocidos (TSS y TES, respectivamente). Las lecturas de CORALL se corresponden con mayor precisión con el TSS exacto de ERCC (Fig. 3A) que las bibliotecas de la competencia, que no cubren los verdaderos sitios de inicio. Además, CORALL proporciona una elevada cobertura en el TES (Fig. 3B).
Análisis de datos
La plataforma BlueBee® Genomics dispone ahora de una línea de análisis de datos. La tubería proporcionada permite a los usuarios del kit realizar el control de calidad de las lecturas, el mapeo, la deduplicación del Identificador Molecular Único (UMI) y la cuantificación de la transcripción. Para utilizar su código de activación, registre una cuenta en BlueBee (https://lexogen.bluebee.com/portal) y cargue sus datos (archivos fastq.gz).
NOTA: El análisis de datos de BlueBee está disponible para una serie de especies, por favor, consulte la FAQ 7. Se pueden añadir genomas de referencia para nuevas especies si se solicita. Por favor, tenga en cuenta que esto conllevará una tarifa. Para más información, consulte la sección de análisis de datos de CORALL.
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