Todas las bacterias y arqueas contienen una subunidad ribosómica conocida como 16S que tiene unos 1.500 nucleótidos de longitud y contiene nueve regiones hipervariables (V1-V9) repartidas entre regiones altamente conservadas que son específicas de género o especie. La secuenciación del gen del ARN ribosómico 16S (ARNr), un marcador genético establecido, es el patrón oro para el análisis de muestras bacterianas para la identificación y clasificación tanto de cultivos puros como del análisis de muestras mixtas. Gracias a la introducción de la secuenciación de próxima generación (NGS), el método del ARNr 16S también se utiliza ahora ampliamente para deconvolucionar comunidades microbianas complejas, como los microbiomas del intestino humano.
La región V1-V9 es más capaz de distinguir especies bacterianas que otras subregiones. EasySeq™ 16S rRNA V1-V6 y V9 Bacterial ID proporciona el análisis completo de las regiones variables V1-6 y V9 del gen 16S rRNA bacteriano. Este kit admite una estrategia de identificación bacteriana impulsada por NGS para enfermedades infecciosas, investigación de contaminación y pruebas de análisis de causa raíz a partir de muestras clínicas.
Compatibilidad del kit y la plataforma
Tenga en cuenta lo siguiente: EasySeq™ 16S rRNA V1-6 and V9 Bacterial ID NGS Library Prep Kit está diseñado para secuenciar las regiones hipervariables V1-V6 y V9 en una reacción multiplex utilizando dos paneles de sondas diferentes. Esto requiere dos placas Unique Dual Index Plates para su uso asociado.
El EasySeq™ 16S rRNA V1-6 and V9 Bacterial ID Sequencing Kit se utiliza con ADN extraído de cultivos puros y también permite la amplificación directa de ADN a partir de materiales clínicos.
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