Software para secuenciación NGS CLC Assembly Cell
de laboratorioanálisis de datosde gestión de datos

software para secuenciación NGS
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Características

Ámbito de aplicación
para secuenciación NGS, de laboratorio
Función
análisis de datos, de gestión de datos

Descripción

Una solución informática de alto rendimiento para la cartografía lee a un conjunto de referencia y de novo de datos de secuenciación de próxima generación. Lee el mapeo de Illumina, Pacific Biosciences, Ion Torrent, SOLiD, y 454 datos de secuenciación Ensamblaje de novo de Illumina, Pacific Biosciences, Ion Torrent y 454 datos de secuenciación Soporte para el ensamblaje y mapeo de lectura corta y larga Con la interfaz de línea de comandos de CLC Assembly Cell, puedes incluir fácilmente estas funcionalidades en los guiones y otros flujos de trabajo de secuenciación de próxima generación. Es fácil de instalar en tu ordenador de sobremesa o en un clúster de computación más grande. Detalles del producto Actuación Benchmarking La última versión de la Célula de Ensamblaje CLC introduce herramientas para la corrección de errores y el ensamblaje de novo del PacBio crudo lee. Se pueden generar ensamblajes de alta calidad en una fracción del tiempo que necesitan las principales alternativas. La CLC Assembly Cell consume menos del 10 por ciento de la memoria utilizada por las soluciones alternativas, mientras que el ensamblaje se completa más rápido. Comparamos el rendimiento del estándar de la industria HGAP1 cuando se ejecuta en un ordenador de alto rendimiento con el rendimiento de un flujo de trabajo de De Novo Assembly en CLC Assembly Cell. Por favor, tengan en cuenta que nuestro De Novo Assembly Pipeline se ejecutó en un portátil estándar para esta comparación. Aplicaciones La Célula de Ensamblaje CLC se acelera mediante implementaciones avanzadas de algoritmos: utilizan el conjunto de instrucciones SIMD para paralelizar y acelerar el cálculo de partes intensivas de los algoritmos, y hacen que el software sea uno de los paquetes más rápidos y precisos para el análisis de datos de NGS en el mercado.

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