Pipelines de análisis de ARN-seq listos para usar con algoritmos CLC de QIAGEN
Compatible con los kits de preparación de bibliotecas más utilizados
Exploración y filtrado fácil e intuitivo de genes expresados diferencialmente en un panel interactivo de fácil uso
Ayuda a la interpretación mediante la anotación de las vías más afectadas, en sentido ascendente
reguladores, enfermedades y funciones consultadas en la Base de Conocimientos de Análisis de Vías de Ingenuidad (IPA) de QIAGEN
Apoyo a la toma de decisiones en experimentos de verificación de biomarcadores con el producto
recomendaciones de productos y cómodas herramientas de diseño personalizado en el QIAGEN GeneGlobe Design & Analysis Hub
Detalles del producto
Las soluciones GeneGlobe Analyze combinan algoritmos y conocimientos líderes en la industria con facilidad de uso. El QIAGEN RNA-seq Analysis Portal basado en la nube es accesible desde GeneGlobe Analyze y permite el análisis de datos RNA-seq, desde la alineación de lecturas en bruto hasta la interpretación de genes expresados diferencialmente y la búsqueda de las herramientas adecuadas para la verificación de biomarcadores potenciales.
Rendimiento
El QIAGEN RNA-seq Analysis Portal reduce el tiempo de análisis de días a unas pocas horas:
análisis de microARN: requiere sólo 90 minutos desde el archivo fastq hasta la expresión diferencial (basado en datos de QIAseq miRNA Library Kit, 96 muestras con ~5M de lecturas por muestra, lecturas single-end de 75 bp)
Análisis del transcriptoma completo: sólo 4 horas desde el archivo fastq hasta la expresión diferencial (basado en datos de QIAseq Stranded RNA Library Kit, 96 muestras, 60M de lecturas por muestra, paired-end 2 x 75 bp reads)
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