Calprotectin está disponible en el lumen intestinal vía el vertimiento del leucocito, la secreción activa, el disturbio de la célula y la muerte celular. Esto da lugar a los niveles fecales elevados del calprotectin, que se pueden detectar en el taburete. Los niveles fecales elevados del calprotectin por lo tanto indican la inflamación intestinal. La gente con los síndromes del intestino irritable activos (IBDs) por ejemplo, colitis ulcerosa o la enfermedad de Crohn tiene tanto como un aumento de diez veces en niveles fecales del calprotectin y la medida del calprotectin puede servir como prueba bioquímica para estas enfermedades.
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