El software Nexus Copy Number permite a los investigadores analizar múltiples tipos de datos -arrays, paneles NGS, WES/WGS y datos de expresión- en cohortes de investigación para obtener una visión de todo el genoma. Revele nuevos conocimientos con increíble simplicidad a través de una variedad de herramientas avanzadas de análisis y visualización.
Integre datos fenotípicos y genómicos para descubrir correlaciones genéticas significativas.
Asocie un número ilimitado de anotaciones o atributos de muestras para análisis posteriores. Utilice la herramienta de poder predictivo para encontrar correlaciones entre atributos fenotípicos y cambios genómicos, realizar análisis de supervivencia de muestras de cáncer (con gráficos de Kaplan-Meir) o estratificar muestras en función de perfiles de aberraciones y fenotipos para identificar mutaciones impulsoras. Nexus Copy Number permite la agrupación mediante K-means o clustering jerárquico con la posibilidad de ajustar el número de clusters. Identifique términos de ontología génica (GO) enriquecidos en todo el genoma mediante GSEA o encuentre términos GO significativamente sobrerrepresentados sólo en regiones seleccionadas. Utilice la función de concordancia para identificar alteraciones genómicas que coincidan con cambios en el número de copias, regiones LOH o pequeñas mutaciones, y represente estas relaciones en un gráfico circular.
Analice y visualice múltiples muestras en paralelo, sin necesidad de conocimientos bioinformáticos.
Nexus Copy Number le proporciona sólidas funciones estadísticas y ricos gráficos interactivos, sin necesidad de conocimientos de programación gráfica y estadística. Es una potente solución de escritorio (Windows o Mac OS) que permite la visualización y el análisis de decenas de miles de matrices de alta densidad en paralelo.
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