Especificaciones
Reacciones 8
Muestras validadas Células y tejidos de mamíferos
Técnica Hi-C
Uso exclusivo de la investigación de etiquetado
Aplicación(es) Análisis de conformación de cromatina, SNP y detección de variantes estructurales
Descripción del producto
El Kit Dovetail™ Omni-C™ utiliza una endonucleasa independiente de la secuencia para la digestión de cromatina antes de la ligadura de proximidad. El Kit Omni-C™ proporciona todos los reactivos necesarios para realizar los pasos de ligadura de proximidad en muestras de mamíferos antes de la generación de la biblioteca NGS. El kit es compatible con el módulo de biblioteca Dovetail™ para Illumina (Cat # 25004) y con los kits de preparación de la biblioteca de pares estándar de terceros para la secuenciación de Illumina.
El Kit Omni-C ofrece los siguientes beneficios clave:
La fragmentación de la cromatina independiente de la secuencia permite la detección de contactos de cromatina en todo el genoma (hasta el 20% del genoma carece de cobertura utilizando enfoques Hi-C basados en enzimas de restricción)
Incluso la cobertura de todo el genoma, similar a la secuenciación de escopeta, permite la llamada de SNP, la fase cromosómica y la detección de variantes estructurales
La menor carga de secuenciación para alcanzar la profundidad de cobertura deseada ahorra tiempo y costos
Las bibliotecas Omni-C permiten una amplia resolución del genoma de las interacciones de la cromatina
Debido al uso de una endonucleasa independiente de la secuencia para la digestión de la cromatina, el Kit Omni-C ofrece todas las características de un enfoque Hi-C sin el sesgo de secuencia inherente a los enfoques Hi-C basados en enzimas de restricción. Comparado con los enfoques Hi-C basados en enzimas de restricción, el Omni-C proporciona los siguientes beneficios:
Superposición significativa con los datos generados mediante enfoques basados en enzimas de restricción pero enriquecidos en lecturas cis de largo alcance
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