Desarrollados en colaboración con expertos en genómica del cáncer, estos oligos prediseñados y listos para usar permiten a los investigadores secuenciar diversos genes y polimorfismos de nucleótido único (SNP) previamente relacionados con la predisposición al cáncer.
Se dirige a 94 genes y 284 SNP asociados a la predisposición al cáncer
TruSight Cancer incluye genes asociados tanto a cánceres comunes (como el de mama o el colorrectal) como a cánceres poco frecuentes. Además, el conjunto incluye 284 SNP que se han correlacionado con el cáncer a través de estudios de asociación de genoma completo (GWAS). La selección de contenidos se basó en la revisión por expertos de la literatura científica y otros recursos de alta calidad.
El panel de secuenciación TruSight Cancer proporciona oligos personalizados dirigidos a las regiones de interés identificadas. Se suministra producto suficiente para cuatro reacciones de enriquecimiento. TruSight Cancer es compatible con TruSight Rapid Capture.
Conjuntos de datos de muestras de TruSight Cancer
se prepararon 6 muestras humanas de referencia utilizando el panel de secuenciación TruSight Cancer. Estas bibliotecas se secuenciaron en el sistema MiniSeq utilizando un kit de alto rendimiento con una configuración de longitud de lectura de 2 x 100 pb con indexación dual. El rendimiento total fue de 5,2 Gb con un 95,8% de bases en o por encima de Q30.
Especificaciones
Tiempo de ensayo - 1,5 días
Tipo de cáncer - Pan-cáncer
Especificaciones de contenido - Conjunto fijo de sondas que enriquecen para 94 genes y 284 SNPs asociados con cánceres comunes y raros.
Descripción - Investigación de detección de mutaciones en la línea germinal para cánceres comunes y raros.
Tiempo práctico - 5 horas
Cantidad de entrada - 50 ng de ADN
Instrumentos - Sistema MiSeq, Sistema NextSeq 550, MiSeqDx en modo de investigación, Sistema MiniSeq, Sistema NextSeq 500
Método - Secuenciación dirigida de ADN, Enriquecimiento de dianas
Multiplexación - Hasta 96 multiplexaciones
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