Analizar la cinética de la síntesis y el recambio del ARN en todo el transcriptoma
Medir la expresión del ARN naciente y la estabilidad del transcrito
Mejorar la resolución temporal de la expresión diferencial
Identificar objetivos transcripcionales primarios y secundarios
No requiere pull-down ni aislamiento bioquímico
Utilícelo en combinación con QuantSeq 3' mRNA-Seq para obtener un coste efectivo,
de alto rendimiento para la secuenciación metabólica
SLAMdunk - análisis de datos SLAMseq-QuantSeq automatizado y fácil de usar
en la plataforma de análisis genómico BlueBee
SLAMseq es un método de alta sensibilidad para la medición resuelta en el tiempo de ARN recién sintetizado y existente en células cultivadas. SLAMseq permite la resolución de la cinética de síntesis y degradación del ARN.
Lexogen ofrece una familia de kits basados en el nuevo método SLAMseq: Alquilación ligada a tiol (SH) para la secuenciación metabólica del ARN. SLAMseq permite identificar y cuantificar el ARN recién sintetizado (naciente) y el existente de la misma muestra en paralelo, sin necesidad de aislamiento bioquímico. SLAMseq puede aplicarse fácilmente a experimentos con células vivas. En combinación con la preparación de bibliotecas QuantSeq 3' mRNA-Seq, SLAMseq proporciona una solución completa, fácil de usar y de alto rendimiento para analizar la síntesis de ARN en todo el transcriptoma y la cinética de recambio.
La cartera de kits SLAMseq incluye los módulos Explorer y Kinetics, que cubren todo el experimento de etiquetado de ARN metabólico, desde la optimización de las condiciones de etiquetado, hasta el etiquetado de ARN naciente o existente y la alquilación para la preparación de bibliotecas NGS posteriores.
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