Software médico LD1
para LAMPde diseñode intercambio

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Características

Aplicaciones
médico, para LAMP
Función
de diseño, de intercambio, de transcripción

Descripción

Evitación automática de estructuras homológicas y de plantillas Opciones de BLAST local y de sobremesa Recuperación automática de secuencias Vista de secuencias Calculadora de cebadores Gestión de datos y bases de datos Generar informe Acerca de LAMP Designer OptiGene ofrece una aplicación de software que se utiliza para diseñar cebadores eficientes para ensayos de amplificación isotérmica mediada por bucle, o LAMP. LAMP es un método de amplificación isotérmica de ADN inventado por la Eiken Chemical Company Ltd de Japón y puede utilizarse para amplificar unas pocas copias de ADN hasta 109 copias en tan sólo 30 minutos. La LAMP acoplada a la transcripción inversa también puede aplicarse para la amplificación de secuencias de ARN. LAMP emplea seis cebadores especialmente diseñados que reconocen ocho regiones distintas en el ADN diana y el diseño de estos seis cebadores es fundamental para el éxito del ensayo. LAMP Designer recupera lotes de secuencias genéticas directamente en el programa a partir de fuentes en línea como GenBank. La aplicación puede realizar una búsqueda BLAST para evitar homologías cruzadas mientras diseña los cebadores. También admite las opciones BLAST local y de escritorio para utilizar bases de datos personalizadas y no publicadas. LAMP Designer incorpora una vista de secuencia con los cebadores marcados en la secuencia, y calcula una temperatura de fusión, Tm, utilizando la teoría termodinámica del vecino más próximo y valores SantaLucia de alta precisión. El software también exporta un informe de calidad de publicación de los ensayos diseñados para compartirlo con colegas. Los datos se organizan en formato de proyecto y se mantiene una base de datos local de información de secuencias y resultados de búsqueda. Evitar homologías cruzadas LAMP Designer interpreta automáticamente los resultados de la búsqueda BLAST

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