Optimizado para la entrada de fragmentos pequeños: Ideal para fragmentos de ADN pequeños y dañados, como el ADN libre de células (cfADN).
Determinación precisa de metilación: El protocolo basado en ligación directa permite lecturas precisas y llamadas de metilación de los extremos nativos de cada fragmento de ADN.
Flujo de trabajo ágil y sencillo: Prepare bibliotecas metil-seq robustas en tan solo 3 pasos.
DESCRIPCIÓN
Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit proporciona un flujo de trabajo optimizado y fiable para la preparación de bibliotecas de secuenciación de bisulfito de genoma completo (WGBS) a partir de ADN libre de células (cfADN). Este kit todo incluido presenta un procedimiento sencillo capaz de preparar bibliotecas metil-seq de alta calidad a partir de tan solo 5 ng de cfADN. El proceso se completa en tres pasos básicos: conversión a bisulfito, ligadura directa del adaptador y amplificación PCR del índice.
El tratamiento inicial con bisulfito es suave con el cfADN pero eficaz para convertir cualquier citosina no modificada en uracilo. A continuación, los innovadores adaptadores astillados capturan y ligan directamente los adaptadores compatibles con Illumina en fragmentos de ADN de cualquier tamaño, lo que permite secuenciar fragmentos de ADN mellados, dañados y cortos que, de otro modo, podrían haberse descartado con los métodos tradicionales de preparación de bibliotecas. La ligación directa de los adaptadores también elimina la necesidad de la síntesis de la segunda cadena, la reparación del extremo y los pasos de cola dA, reduciendo así el sesgo al preservar la integridad de cualquier metilación nativa que esté presente en los extremos del fragmento. Por último, el cfADN ligado con el adaptador se indexa y amplifica mediante PCR con UDIs Zymo-Seq, generando bibliotecas listas para la secuenciación en cualquier instrumento Illumina.
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