El kit de NGS más simplificado con sólo 30 minutos de tiempo práctico para 96 muestras.
100% automatizado con un solo paso de PCR y sin necesidad de normalización.
La PCR en tiempo real permite la cuantificación absoluta del número de copias microbianas.
DESCRIPCIÓN
El Quick-ITS Plus NGS Library Prep Kit es la preparación de bibliotecas NGS más rápida y sencilla dirigida a la región ITS para secuenciación de alto rendimiento. El protocolo de fácil automatización utiliza una sola qPCR/PCR para la amplificación dirigida combinada y la adición de código de barras utilizando cebadores especialmente diseñados. Tras la agrupación por volúmenes iguales, se realiza una única limpieza de la biblioteca final, en lugar de limpiezas masivas basadas en microesferas AMPure®. No son necesarios análisis adicionales de cuantificación de bibliotecas, como el análisis TapeStation® o la electroforesis en gel. Con estas características, el flujo de trabajo reduce drásticamente el tiempo de preparación de bibliotecas a sólo 30 minutos.
Tamaño del amplicón - El tamaño final del amplicón tras la PCR de 1 paso (amplificación dirigida y adición del código de barras) es de ~480 pb.
Secuencias de código de barras - Códigos de barras de 10 pb, disponibles para su descarga aquí (sólo EE.UU.), o en la sección Documentos como "Secuencias de código de barras".
Index Primers - Índice doble (códigos de barras) para etiquetar muestras de forma única.
Secuencias de cebadores ITS - (adaptadores no incluidos)
ITS3f (GCATCGATGAAGAACGCAGC, 20 pb), ITS4r (TCCTCCGCTTATTGATATGC, 20 pb).
Equipo necesario - Microcentrifugadora, centrifugadora de placas, sistema de PCR cuantitativa en tiempo real de 96 pocillos (compatible con SYBR Green) o sistema de PCR estándar y placas de PCR en tiempo real de 96 pocillos.
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