Datos de referencia de búsqueda construidos para la integración del Nexus
Nexus DB es un recurso invaluable e incluido en todas las suscripciones del Número de Copia de Nexus.
Características y beneficios
Almacene sus propios datos
Como usuario de Nexus, puedes usar NexusDB para almacenar tus propios datos, de forma privada. Los datos se aseguran fuera del sitio usando la plataforma AWS de Amazon.
Datos de referencia
Consulta por gen o región de interés para encontrar rápidamente muestras y anotaciones clínicas, con la posibilidad de comparar los datos generados por diferentes plataformas de aCGH, SNP array y NGS.
Datos de referencia en el Nexus DB
Capacidad de compartir fácilmente sus propios datos con las personas que elija y colaborar en todo el mundo.
Datos disponibles en Nexus DB
Genética constitucional
ACUERDO - Intercambio de Investigación Genética sobre el Autismo. Todos los datos disponibles en el genoma de HG18 y HG19 se construyen.
ISCA/ICCG (dbVAR) - Base de datos de variación estructural (SV) de variantes genómicas con anotaciones clínicas para una amplia gama de trastornos genéticos constitucionales.
Proyecto de referencia CytoScan HD de Affymetrix - 375 muestras normales utilizadas para crear el archivo de referencia de CytoScan HD
Cáncer
TCGA Premier - datos del TCGA reprocesados y curados manualmente, lo que resulta en un aumento drástico de la fidelidad y la correspondiente reducción de llamadas falsas positivas.
Los conjuntos de datos incluyen Leucemia Mieloide Aguda, Glioblastoma (GBM), adenocarcinoma de quistes serios de ovario, carcinoma de células claras de riñón, adenocarcinoma de colon, carcinoma escamoso de pulmón y más.
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