Nuestro kit DepleteX High Expressing RNA Depletion elimina los transcritos de mayor expresión in vitro antes de la secuenciación, redistribuyendo el ~70%* de las lecturas de secuenciación a transcritos únicos biológicamente relevantes, lo que permite maximizar la detección de transcritos de baja expresión o isoformas raras.
Aumente la sensibilidad de detección en fibroblastos y sangre total
La resecuenciación de transcritos de alta expresión añade poca información biológicamente relevante. Lamentablemente, estos transcritos compiten con los de baja expresión por la cobertura de la secuenciación. Esta falta de cobertura, junto con el ruido significativo de los transcritos de alta expresión, limita la detección de los genes de baja expresión, las variantes raras y los eventos de fusión únicos que pueden ser impulsores de enfermedades.
DepleteX aprovecha Cas9 y un conjunto de ARN guía diseñado para eliminar el 70% de los transcritos de mayor expresión de las bibliotecas de ARN-Seq seleccionadas por poli-A derivadas de fibroblastos y sangre total. Este conjunto de guías se diseñó para maximizar la reasignación de las lecturas de secuenciación totales con el fin de aumentar la cobertura de secuenciación de transcritos raros de baja expresión y eventos de fusión únicos.
Aspectos destacados
Elimina >4.000 transcritos de alta expresión en sangre total y fibroblastos
Asignación de un ~70%* más de lecturas a transcritos de baja expresión biológicamente relevantes
Maximizar la detección de variantes e isoformas con menos secuenciación
Mayor detección de transcritos de baja expresión
Se integra fácilmente en su flujo de trabajo con un protocolo sencillo y flexible
Acerca de
El kit incluye ARN guía y reactivos de depleción para la depleción posterior a la biblioteca.
Especificación
Muestras por kit - 24
Tejidos evaluados en el diseño - Fibroblastos, sangre total
Contenido de depleción - ~4.450 transcritos de alta expresión
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