El panel de depleción de ARN DepleteX elimina los transcritos de insulina de mayor expresión in vitro antes de la secuenciación, redistribuyendo los grupos de secuenciación a transcritos únicos biológicamente relevantes, lo que le permite maximizar el UMI y la sensibilidad génica.
Más allá de la ribodepleción, las muestras de ARN suelen tener un pequeño número de transcritos altamente expresados y bien caracterizados, y la resecuenciación de estos transcritos añade poca información biológicamente relevante. Por desgracia, estos transcritos de alta expresión compiten con los de baja expresión por la cobertura de secuenciación. Esta falta de cobertura de la secuenciación, junto con el ruido significativo de los transcritos de alta expresión, limita la detección de genes de baja expresión, variantes raras y eventos de fusión únicos que pueden ser causantes de enfermedades.
Aspectos destacados
Panel de insulina diseñado para eliminar los transcritos de sobreexpresión en muestras de páncreas
Reasignación de lecturas de secuenciación a transcritos de menor expresión para aumentar la cobertura
Maximiza la detección de variantes e isoformas con menos secuenciación
Acerca de
El kit contiene ARN guía específico de tejido y reactivos de depleción para la depleción posterior a la biblioteca
Especificación
Muestras por kit - 24
Tejidos evaluados en el diseño - Páncreas
Diseñado para agotar - 2 genes de insulina
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