Kit de reactivos en solución QuantSeq-Pool

de preparación de bancos de ARN

Método de análisis de expresión génica rentable para proyectos de cribado La agrupación temprana y el procesamiento por lotes ahorran tiempo sin esfuerzo Fácilmente escalable desde unas pocas hasta 36.864 muestras QuantSeq-Pool es la solución óptima para la elaboración de perfiles de expresión génica en proyectos de cribado de gran envergadura, ya que utiliza el código de barras de las muestras, el agrupamiento temprano y el procesamiento por lotes de hasta 96 muestras en una sola reacción, proporcionando un flujo de trabajo fácilmente escalable para multiplexar hasta 36.864 muestras. Alta especificidad de cadena QuantSeq-Pool mantiene una excepcional especificidad de hebra de >99,9% y permite mapear las lecturas a su correspondiente hebra en el genoma, lo que permite descubrir y cuantificar transcritos antisentido y genes solapados. Recuento directo para la cuantificación de la expresión génica Sólo se produce un fragmento por transcripción, por lo que no es necesario normalizar su longitud. Esto permite una determinación más precisa de los valores de expresión génica y convierte a QuantSeq en la mejor alternativa a los microarrays y al RNA-Seq convencional en los estudios de expresión génica. Análisis bioinformático sencillo El mapeo de lecturas se simplifica omitiendo la detección de uniones. Las lecturas se generan en el extremo 3′ de los transcritos, donde casi no hay uniones. Por lo tanto, el procesamiento de datos puede acelerarse utilizando, por ejemplo, Bowtie2 en lugar de TopHat2. Identificadores moleculares únicos Los UMIs están integrados en QuantSeq-Pool y se introducen en el primer paso del protocolo. Los UMIs tienen una longitud de 10 nucleótidos y se leen al principio de la Lectura 2. Utilice la información del UMI para identificar duplicados de PCR y eliminar el sesgo de amplificación.