La secuenciación de ARN unicelular suele requerir como entrada una suspensión unicelular preparada a partir de muestras frescas. Para la secuenciación unicelular de tejidos congelados, ofrecemos un producto especializado, el GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit. El GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit es una solución completa para transformar tejidos en núcleos únicos y convertir el ARNm contenido en los núcleos únicos en bibliotecas NGS.
El GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit no sólo se puede utilizar para analizar muestras de tejidos congelados, sino que también se puede aplicar para la secuenciación de núcleos únicos de las células congeladas aisladas por clasificación FACS. Además, el GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit también se puede utilizar para el análisis unicelular de células de gran diámetro o forma irregular, como las neuronas.
Ejemplo de un conjunto de datos experimental
Se procesó tejido congelado de hipocampo de cerebro de ratón utilizando el GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit. Tras aislar los núcleos, particionarlos y codificarlos con barras, se secuenció una biblioteca de núcleo único y se agruparon los datos obtenidos. A partir de los perfiles de expresión de los genes marcadores, se anotaron los principales subtipos celulares (neuronas excitadoras, neuronas inhibidoras, células gliales, neuroblastos y oligodendrocitos) utilizando la base de datos SynEcoSys.
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