FocuSCOPE™ es una solución de secuenciación multiómica unicelular de alto rendimiento que puede detectar tanto variantes genéticas como el transcriptoma de las mismas células individuales. De este modo, FocuSCOPE™ proporciona una herramienta para descifrar la conexión entre el genotipo y el fenotipo a nivel unicelular.
La tecnología FocuSCOPE™ tiene dos elementos clave: micropartículas de codificación celular conjugadas con oligos que pueden capturar eficientemente tanto el ARNm como sus secuencias de interés; y química de reacción optimizada para la amplificación y construcción de bibliotecas tanto de secuencias de ARNm como de secuencias de regiones diana. FocuSCOPE™ se ha utilizado para realizar con éxito análisis unicelulares tanto de perfiles de expresión génica como de mutaciones puntuales, genes de fusión o secuencias virales intracelulares simultáneamente, a partir de miles de células a la vez. Los datos multiómicos adquiridos proporcionaron una visión más completa de cada célula individual.
Perlas únicas diseñadas a medida
Con las microesferas AccuraCellTM de Singleron, de diseño exclusivo, se pueden capturar simultáneamente hasta 5 áreas diana, cada una de ellas de menos de 200 pb. Se construirán dos bibliotecas a partir de la misma muestra, una biblioteca para la transcriptómica completa con las sondas de poli (dT) y una biblioteca para las secuencias diana con sondas personalizadas. Por lo tanto, la información sobre el tipo de célula, así como las secuencias específicas (mutación, gen de fusión o secuencia viral), pueden detectarse en la misma célula.
Detección específica de mutaciones conductoras
Los kits FocuSCOPE® detectan mutaciones determinantes en tejidos heterogéneos con gran especificidad. En un conjunto de datos de demostración de una mezcla de tres líneas celulares, la línea celular H1975 es portadora de la mutación puntual EGFR T790M y la línea celular A549 es portadora de la mutación KRAS G12S.
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