Software para secuenciación NGS NextGENe®

de análisisde laboratorio

El software NextGENe es el socio analítico perfecto para el análisis de datos de secuenciación de escritorio producidos por los sistemas Illumina® iSeq, Miniseq, MiSeq, NextSeq, HiSeq y NovaSeq, los sistemas Ion Torrent Ion GeneStudio S5, PGM y Proton, así como otras plataformas. El software NextGENe se ejecuta en un sistema operativo Windows®, que proporciona una interfaz "apuntar y hacer clic" fácil de usar para los biólogos. No requiere secuencias de comandos ni otros soportes bioinformáticos, que suelen ser necesarios cuando se utilizan programas como CLC Genomics Workbench, SeqMan Pro de Lasergene, así como software académico como MAQ & SOAP, Top Hat, BWA & Bowtie. El software NextGENe emplea tecnologías únicas específicas de la plataforma en un paquete multiaplicación independiente. El software NextGENe contiene módulos de análisis para: Detección de SNP/Indel Línea germinal Somática Captura del exoma, secuenciación del exoma completo (WES) Secuenciación del genoma completo (WGS) Análisis de variantes estructurales (incluida la detección de genes de fusión) Comparaciones entre familias y tríos Comparaciones tumor-normal Detección de variaciones en el número de copias (CNV) y alternativas al cribado tipo MLPA ensamblaje de novo Transcriptoma; análisis de splicing alternativo y niveles de expresión de transcritos ChIP-Seq, expresión génica digital (DGE), análisis y cuantificación de miARN y metagenómica El software NextGENe está diseñado en un entorno Windows® fácil de usar para los biólogos, lo que reduce significativamente la necesidad de recursos y costes bioinformáticos adicionales. El software NextGENe utiliza hardware de bajo coste basado en el sistema operativo Windows de 64 bits. (Haga clic aquí para ver la configuración de hardware sugerida)