El kit de preparación de bibliotecas de ADN NGS sin PCR se desarrolló para la construcción de bibliotecas de ADN para la secuenciación de próxima generación (plataforma illumina). El kit añade adaptadores de biblioteca de cola 3′-dT a ambos extremos de los fragmentos de ADN de manera eficiente. El kit utiliza fragmentos de ADN de doble cadena (roma y/o pegajosa) como ADN de entrada para la construcción de bibliotecas NGS, y es compatible con fragmentos de ADN generados tanto por métodos enzimáticos (enzimas de fragmentación de ADN BioDynami, etc.) como por métodos físicos (sonicación, nebulización, etc.)
La amplificación por PCR es un paso estándar para la preparación de bibliotecas de Next-Generation Sequencing. La PCR se utiliza para amplificar fragmentos de ADN completamente ligados y para añadir información de indexación a las bibliotecas. La indexación sirve para agrupar las muestras de la biblioteca en un esfuerzo por reducir el coste de la secuenciación.
Sin embargo, la PCR introduce una amplificación desigual del ADN en algunas regiones de ADN con contenidos extremos de GC y estructuras secundarias. Este sesgo puede causar una cobertura de secuenciación muy baja en dichas regiones. La secuenciación del ADN en estas regiones sigue siendo un gran reto.
La preparación de bibliotecas sin PCR puede reducir el sesgo de la biblioteca y minimizar las lagunas de secuenciación. Los datos de secuenciación de muestras de bibliotecas sin PCR tienen una cobertura genómica uniforme con pocas lagunas y mejor profundidad en las regiones ricas en GC. Nuestro kit NGS sin PCR ofrece una cobertura óptima en las regiones tradicionalmente difíciles, como las regiones con alto contenido en GC, las regiones con bajo contenido en GC y las regiones de secuencias repetitivas.
Hay dos tipos de índices disponibles para el kit:
Sin índice: Las bibliotecas no tienen índice.
Índice: Cada biblioteca contiene un índice i5 y un índice i7. Es posible multiplexar bibliotecas hasta 96 muestras. La lista de índices puede descargarse aquí.
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