Módulo de software para secuenciación HLA SEQHLA

de laboratoriode análisis

SEQHLA es una aplicación potente y fácil de usar para el análisis de datos de tipificación basados en secuencias HLA de todas las plataformas de secuenciación Sanger. Todas las versiones de la base de datos HLA de IMGT están disponibles para su descarga e importación. Utiliza un llamador de bases de aprendizaje único basado en datos estadísticos de área de pico y tiene su propia función de edición automática. Las posiciones constantes pueden ignorarse para el análisis si se desea. El resultado puede mostrarse en resolución máxima, de 1 campo o de 2 campos y como código NMPD. Todos los datos de los resultados pueden transferirse a los sistemas LIM internos del laboratorio y/o emitirse como informes personalizados del paciente. Compatible con datos de todas las plataformas y kits de secuenciación Sanger habituales Fácil configuración de regiones diana individuales basadas en la base de datos IMGT HLA Llamador de bases configurable con umbrales dependientes del secuenciador Recorte automático y definido por el usuario de los archivos de resultados de secuenciación Todos los resultados de un paciente se muestran en una pantalla, incluidas las combinaciones de alelos detectadas Advertencia automática de mutaciones en sitios de empalme Posibilidad de ignorar posiciones constantes para el análisis Detección de nuevos alelos Visualización de los resultados en diferentes resoluciones (1 campo, 2 campos y resolución máxima) y como código NMDP Estadística de área de pico: comparación automática con todas las muestras analizadas previamente para una detección sensible de posiciones heterocigotas incluso en caso de abandono alélico Informe HLA detallado para pacientes / pedidos individuales