Kit flexible para la secuenciación dirigida y el código de barras molecular
Identificación de transcritos de fusión conocidos y desconocidos
Uso de cebadores específicos de genes diseñados a medida para la síntesis de la primera
y/o la segunda cadena de síntesis
Alternativa rentable y flexible a los paneles de secuenciación prediseñados
Secuenciación de hasta 9.126 muestras/carril
El kit QuantSeq-Flex es un protocolo de preparación de bibliotecas diseñado para crear bibliotecas compatibles con Illumina a partir de cualquier muestra de ARN utilizando cebadores personalizados. Está abierto a que los usuarios avanzados de RNA-Seq lo desarrollen en función de sus necesidades personalizadas.
El kit se basa en la estrategia del QuantSeq FWD Kit for Illumina (Cat. No. 015), con reactivos compatibles y la secuencia de enlace de la lectura 1 introducida por el primer de síntesis de la segunda cadena. Por lo tanto, las lecturas generadas durante la ejecución de NGS corresponden directamente a la secuencia de ARN.
El kit QuantSeq-Flex proporciona módulos para la transcripción inversa (RT) y la SSS, permitiendo a los usuarios elegir sus propios cebadores para uno de estos pasos o para ambos. Esto ofrece la máxima flexibilidad en la elección de objetivos y material de entrada.
Con este kit QuantSeq altamente flexible se pueden generar los siguientes tipos de bibliotecas:
1.) OligodT cebado en la transcripción inversa, cebado al azar en la síntesis de la segunda cadena (QuantSeq 3' mRNA-Seq)
2.) OligodT cebado en transcripción inversa, cebado específicamente en la segunda cadena (targeted 3' mRNA-Seq)
3.) Cebado específico de la diana en la transcripción inversa, cebado aleatorio en la síntesis de la segunda cadena (RNA-Seq dirigido, permite la identificación de nuevas fusiones)
4.) Cebado específico de la diana en la transcripción inversa, cebado específico de la diana en la síntesis de la segunda cadena (RNA-Seq dirigido, sólo se pueden detectar las dianas conocidas)
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