Kit de prueba para el cáncer AVENIO CGP V2

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Resumen
El AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 incluye reactivos para aislar ADN de tejido FFPE, preparar bibliotecas de secuenciación y enriquecer regiones de interés utilizando el AVENIO Tumor Tissue CGP Panel V2. El kit incluye análisis secundario en la nube (FoundationOne® Analysis Platform) y software de gestión de datos (AVENIO Connect). Emplea un flujo de trabajo de captura híbrida de ADN para el perfilado genómico integral de tejido tumoral sólido FFPE y permite la detección de múltiples clases de alteraciones genómicas y firmas genómicas complejas.

Aplicación
Ensayo NGS interno para uso en investigación (RUO) para el perfilado genómico integral de tumores sólidos utilizando ADN derivado de tejido FFPE. Diseñado para generar información genómica sobre variantes de nucleótido único (SNV), inserciones y deleciones (InDels), alteraciones en el número de copias (CNA), reordenamientos y firmas complejas como carga mutacional tumoral (TMB), inestabilidad de microsatélites (MSI), pérdida genómica de heterocigosidad (gLOH) y firma de deficiencia de recombinación homóloga (HRDsig).

Ventajas principales

• Apoyo de experiencia: Basado en la tecnología Foundation Medicine y la experiencia de Roche para proporcionar perfilado genómico integral con amplia experiencia clínica e investigadora.
• Cobertura genómica amplia y diversa: Analiza 335 genes relevantes y múltiples clases de alteraciones, además de firmas genómicas complejas (TMB, MSI, gLOH, HRDsig).
• Flujo NGS rápido y conveniente: Un único flujo de trabajo desde la extracción de ADN hasta el análisis de datos; preparación de bibliotecas en 2 días, pasos de ligación cortos y un tiempo de respuesta de hasta ~5 días desde la extracción de ADN hasta los resultados.

Rendimiento analítico
Clasificación - variantes/firmas detectadas
Variantes cortas - 99,7%
Reordenamientos - 89,9%
CNA - 99,6%
MSI alto - 100%
TMB alto - 100%
gLOH alto - 100%
HRDsig positivo - 91,7%

Información de pedido / variantes del kit

• Número de material 10240814001 — AVENIO Tumor Tissue CGP Kit A V2 — Placa A: 24 reacciones — EAN: 07613336230862
• Número de material 10240822001 — AVENIO Tumor Tissue CGP Kit B V2 — Placa B: 24 reacciones — EAN: 07613336230879
• Cada kit incluye reactivos para procesar hasta 24 reacciones, agrupadas en dos o tres corridas de secuenciación de hasta 8–12 bibliotecas en un Illumina NextSeq 500/550 o NextSeq 550 Dx en modo RUO.

Aviso regulatorio
Solo para uso en investigación. No utilizar en procedimientos de diagnóstico.

Características / especificaciones técnicas

• Panel: Panel de 335 genes alineado con el diseño del panel FoundationOne® CDx; mide SNV, InDels, reordenamientos (RE) y CNA además de las firmas MSI, TMB, gLOH y HRDsig.
• Tipo de muestra: Tejido FFPE o ADN derivado de tejido FFPE.
• Reactivos: Reactivos conformes a REACH, sin xileno; tamaño de paquete para 24 reacciones.
• Compatibilidad de secuenciación: Illumina NextSeq 500/550/550Dx (modo RUO): hasta 12 muestras por flowcell de alto rendimiento; Illumina NovaSeq 6000 (exploratorio): hasta 24 muestras en flowcell SP o hasta 48 en flowcell S1; admite multiplexado con muestras no CGP cuando los códigos de barras no entren en conflicto.
• Flujo de trabajo: Flujo manual basado en captura híbrida desde la extracción de ADN hasta la preparación y el enriquecimiento de bibliotecas.
• Análisis de datos: FoundationOne® Analysis Platform para análisis secundario y AVENIO Connect para gestión de datos; compatibilidad optimizada con navify® Mutation Profiler para análisis terciario (opcional).
• Tiempo de respuesta: Hasta 5 días desde la extracción del ADN hasta la generación de resultados (workflow y condiciones de secuenciación típicas descritas por Roche).
• Notas analíticas: Las métricas de rendimiento se derivan de la comparación con FoundationOne® CDx a ~60 millones de lecturas por muestra (Illumina NextSeq 550) con cortes definidos para las firmas; los usuarios deben determinar los cortes de firma apropiados para su uso de investigación.