Descripción generalLos adaptadores KAPA son adaptadores de ligación de longitud completa y truncados para la construcción de bibliotecas NGS de ADN y ARN, compatibles con plataformas de secuenciación Illumina. Permiten multiplexación flexible y reducen errores de asignación de índices mediante esquemas de índice doble único (UDI) y UMIs opcionales, con configuraciones de hasta 384-plex.
Tipos de adaptadores- Adaptadores de longitud completa: KAPA UDI Adapters — diseñados para preparación de muestras sin PCR; proporcionan combinaciones UDI únicas no redundantes, suministrados a 15 µM.
- Adaptadores truncados: KAPA Universal Adapter y KAPA Universal UMI Adapter — permiten mayor capacidad de índices y opción UMI; suministrados a 15 µM (Universal) y 33 µM (Universal UMI).
- Mezclas de cebadores KAPA UDI: Placas de cebadores preformateadas que cubren conjuntos de índices 1–384 para usar con adaptadores Universal; validadas para flujos UMI y no‑UMI.
Beneficios clave- Mitigación de error de índice: la indexación doble única permite filtrar pares de códigos de barras inesperados antes del análisis, reduciendo artefactos de index hopping.
- Control de calidad basado en secuenciación y fabricación controlada para minimizar la contaminación cruzada de códigos de barras.
- Conversión consistente entre métodos de fragmentación (Covaris y fragmentación enzimática) para un rendimiento robusto de las bibliotecas.
- Compatibilidad con flujos de trabajo WGS humanos sin PCR cuando se usan con KAPA EvoPrep y KAPA EvoPlus V2.
- Multiplexación flexible desde bajo plex hasta 384-plex según la configuración de adaptador y mezcla de cebadores.
Uso recomendado- Construcción de bibliotecas NGS por ligación para ADN y ARN.
- Preparación de bibliotecas sin PCR con KAPA UDI Adapters y kits KAPA validados.
- Proyectos de secuenciación de alto rendimiento que requieren mitigación de index hopping y demultiplexado de muestras fiable.
Resumen comparativo de adaptadores KAPANúmero de UDIs: 96 (KAPA UDI Adapters) / 384 (KAPA Universal Adapter / KAPA Universal UMI Adapter)
Número de códigos de 8 nt P5 + P7 no redundantes: 96+96 / 384+384 / 384+384
Códigos idénticos a los adaptadores suministrados por Illumina: No / No / No
Recomendado para instrumentos Illumina (flow cells patterned o no): Sí / Sí / Sí
Preparación sin PCR (codificado molecularmente): No / No / No
Validado para KAPA EvoPrep Kit, KAPA EvoPlus V2 Kit: Validado / Compatible / Compatible
Validado para KAPA RNA EvoPrep Kit: Validado / Validado / Compatible
Compatible con KAPA Universal Enhancing Oligos: Sí / Sí / Sí
Formulación del adaptador: Longitud completa listo para usar 15 µM (4 reacciones/adaptador) / Truncado listo para usar 15 µM (1 reacción/adaptador) / Truncado listo para usar 33 µM (1 reacción/adaptador)
Configuración del kit: Placa rígida de 96 pocillos con etiquetado apto para automatización, sobrellenado y sellos de reemplazo (KAPA UDI Adapters) / Tubos de adaptador y placas de 96 pocillos con mezcla de cebadores con etiquetado apto para automatización y sobrellenado (variantes Universal/UMI)
Buffer de dilución de adaptador KAPA incluido: Sí (25 mL por kit KAPA UDI) / No incluido para adaptadores truncados
Rendimiento y control de calidad- Ensayos de control de calidad internos basados en secuenciación evalúan la contaminación cruzada de códigos de barras ligando cada UDI a un insert sintético único, agrupando y secuenciando las bibliotecas y analizando la distribución de lecturas por par código/insert.
- Los UDI no redundantes reducen sustancialmente la contaminación aparente atribuible al index hopping respecto a la indexación simple.
- Datos internos muestran tasas de contaminación reducidas y conversión/cobertura uniforme frente a otros métodos de preparación de bibliotecas.
Características / especificaciones técnicas- Familia de productos: adaptadores KAPA y accesorios.
- Opciones de adaptadores: KAPA UDI Adapters (longitud completa, 15 µM), KAPA Universal Adapter (truncado, 15 µM), KAPA Universal UMI Adapter (truncado, 33 µM).
- Combinaciones UDI: 96 (KAPA UDI Adapters) o hasta 384 (Universal / UMI con mezclas de cebadores).
- Formato de código de barras: P5 + P7 no redundantes de 8 nt.
- Configuración del kit: Placas rígidas de 96 pocillos y tubos adaptadores con etiquetado apto para automatización y sobrellenado cuando corresponda.
- Consumibles incluidos: Buffer de dilución de adaptador KAPA (25 mL) incluido con kits KAPA UDI; no incluido con adaptadores truncados.
- Instrumentos previstos: Instrumentos de secuenciación Illumina (flow cells patterned y no-patterned).
- Aplicaciones validadas: Preparación de bibliotecas NGS de ADN y ARN; WGS humano sin PCR cuando se usa con KAPA EvoPrep / KAPA EvoPlus V2; compatibilidad RNA EvoPrep según indicación.