Kit de reactivos en solución KAPA HyperPETE

para la investigaciónpara ADN

El flujo de trabajo KAPA HyperPETE es una novedosa tecnología de captura híbrida diseñada para emplear reacciones de extensión de cebadores con el fin de capturar y liberar de forma específica moléculas de la biblioteca objetivo para su secuenciación. Los paneles del catálogo KAPA HyperPETE incluyen paneles de diseño fijo fácilmente disponibles para variantes oncológicas generales (con un módulo MSI), puntos clave oncológicos, oncología hereditaria, variantes de fusión del cáncer de pulmón y cribado neonatal. Estos paneles de diseño fijo se basan en más de una década de experiencia en el diseño de sondas. Ventajas de un vistazo Desarrollado para descubrir información genómica crítica a partir de tipos de muestras difíciles ARN tisular (FFPET) Consigue un enriquecimiento altamente específico a partir de una amplia gama de cantidades de ARN FFPET de entrada (Figura 1) Detecta todas las fusiones presentes en muestras de líneas celulares de referencia (Tabla 1) ADN libre en plasma (cfDNA) Consigue un alto porcentaje de lecturas en el objetivo y una elevada cobertura de exones (≥1000X) para un amplio rango de cantidades de cfDNA de entrada (Figura 2) Detecta variantes con alta sensibilidad, a partir de un amplio rango de cantidades de cfDNA de entrada en plasma Rendimiento con ARN FFPE utilizando el panel de fusiones KAPA HyperPETE LC. El panel de fusiones para cáncer de pulmón KAPA HyperPETE alcanzó un porcentaje de lecturas en el objetivo del 92 % al 97 % a partir de 10 ng y 50 ng de todas las muestras de ARN FFPE analizadas. Se demostró una alta especificidad gracias al elevado porcentaje de lecturas en el objetivo al partir de 10 ng o 50 ng de ARN de FFPE de entrada de diversa calidad (baja, media, alta). La tasa de lecturas en el objetivo fue del 92 % al 97 % (incluidos los objetivos de control interno y de fusión), con un buen rendimiento en todas las cantidades, calidades y tipos de muestras de entrada. La tasa de lecturas en el objetivo se calculó tras la eliminación de las lecturas de ARN ribosómico (entre el 0,8 % y el 11 % del total de lecturas). Se utilizaron dos (2) muestras de líneas celulares (en duplicado) y catorce (14) muestras FFPET adyacentes normales para evaluar el rendimiento.