Dado que la preparación de muestras para secuenciación de nueva generación (NGS) conlleva multitud de pasos y cada uno de ellos es fundamental para el éxito y la eficacia de la secuenciación en general, es necesario optimizar todos los pasos en términos de reactivos y protocolo. Teniendo en cuenta la valiosa naturaleza de las muestras NGS, es necesario un flujo de trabajo integrado con reactivos optimizados que conviertan las muestras en una biblioteca lista para la secuenciación. Los tipos de muestras NGS pueden diferir en cuanto a su:
Facilidad de secuenciación - uniforme o con estructuras secundarias o áreas ricas en GC
Calidad - recién extraídas o conservadas (fijadas en formol e incluidas en parafina - FFPE)
Flujos de trabajo flexibles - flujos de trabajo de ADN y ARN optimizados para las aplicaciones
Teniendo en cuenta todas estas variaciones, es importante utilizar reactivos de preparación de bibliotecas que puedan trabajar eficazmente con todos estos tipos de muestras. Los reactivos de preparación de bibliotecas de alta calidad ayudan a obtener una cobertura uniforme y mejorada, así como menores tasas de duplicación. Dependiendo del objetivo final (por ejemplo, la secuenciación del exoma completo), también puede ser necesario un paso de enriquecimiento de dianas para enriquecer regiones específicas de interés. El uso de reactivos de enriquecimiento de dianas de alta eficacia ayuda a obtener una cobertura uniforme y de gran profundidad con una alta especificidad (tasa de on-target) en las regiones objetivo.
El flujo de trabajo KAPA HyperPETE combina productos validados tanto para la preparación de bibliotecas KAPA como para el enriquecimiento de dianas KAPA. Proporciona todos los accesorios y reactivos necesarios para la preparación de muestras, desde ADN o ARN hasta el secuenciador en un flujo de trabajo de un solo día. Los nuevos paneles KAPA HyperPETE proporcionan una alta eficiencia de captura, uniformidad de secuenciación con menos optimización y mayor confianza en la detección de variantes.
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