Mejora la precisión y el rendimiento con los adaptadores y accesorios KAPA
En la secuenciación de nueva generación (NGS), el uso de adaptadores indexados para codificar las muestras aumenta considerablemente la eficiencia. Este proceso, conocido como multiplexación, permite agrupar numerosas muestras en una sola sesión de secuenciación, y las lecturas resultantes se clasifican posteriormente mediante bioinformática.
Sin embargo, algunos secuenciadores de alto rendimiento son propensos a la asignación errónea de índices (index hopping), lo que puede reducir la calidad de los datos. Las estrategias de indexación dual única (UDI) ayudan a mitigar el impacto de estos eventos.
Roche ofrece dos tipos de adaptadores KAPA:
Adaptadores de longitud completa: para la preparación de muestras sin PCR con hasta 96 combinaciones de índices
Adaptadores KAPA UDI
Ventajas de un vistazo
Las bajas tasas de asignación errónea aumentan la confianza en los resultados
La asignación errónea de índices durante la secuenciación multiplexada puede deberse a varios factores, entre ellos:
Salto de índices
Contaminación cruzada de códigos de barras o muestras
Cambio de molde durante la amplificación por PCR de muestras agrupadas
Errores de secuenciación o análisis
Algunos de estos problemas pueden mitigarse mediante un diseño cuidadoso de los adaptadores y un control de calidad riguroso.
Los adaptadores UDI de KAPA están diseñados para garantizar resultados fiables gracias a:
Combinaciones únicas de índices dobles que permiten filtrar las lecturas con combinaciones inesperadas de códigos de barras antes del análisis de datos
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