Kit de prueba de diagnóstico cobas®

para COVID-19de enfermedades respiratoriasde enfermedades respiratorias

Resumen
cobas® Respiratory flex es una prueba automatizada, multiplex y cualitativa de ácidos nucleicos para uso en los sistemas cobas® 5800/6800/8800 que utiliza PCR en tiempo real y la tecnología TAGS (Temperature Activated Generation of Signal) de Roche para permitir la detección y diferenciación simultánea de múltiples dianas virales respiratorias en un solo pocillo. El ensayo proporciona hasta 12 resultados virales más un control interno de ARN por pocillo y está destinado al uso diagnóstico in vitro (IVD) en muestras de hisopo nasofaríngeo de individuos con signos y síntomas de infección de las vías respiratorias, junto con factores clínicos y epidemiológicos.

Uso previsto / Aplicación clínica
Detección cualitativa y diferenciación de ácidos nucleicos virales respiratorios para ayudar en el diagnóstico de infección respiratoria cuando se utiliza con información clínica y epidemiológica. Los resultados negativos no excluyen la infección; los resultados positivos no descartan la coinfección y pueden no indicar la causa definitiva de la enfermedad. Debido a la similitud genética entre rinovirus humano y enterovirus, el ensayo no puede diferenciarlos de forma fiable.

Características clave y proceso

• Preparación de muestras totalmente automatizada (extracción y purificación de ácidos nucleicos) seguida de amplificación PCR y detección en los sistemas cobas® 5800/6800/8800.
• Extracción simultánea de ácidos nucleicos y control interno de ARN (RNA IC); el ácido nucleico se libera mediante proteinasa y reactivo de lisis, se une a partículas de vidrio magnético, se lava y se eluye.
• La tecnología TAGS permite la diferenciación de múltiples dianas por canal de fluorescencia combinando 5 canales de fluorescencia con 3 canales de detección térmica (T1, T2, T3), permitiendo la detección/diferenciación de hasta 15 dianas por pocillo en implementaciones futuras y hasta 12 resultados virales respiratorios más el RNA IC con este kit.
• El master mix contiene una ADN polimerasa termoestable, sondas TAGS y dUTP más AmpErase (uracil-N-glicosilasa) para control de contaminación por arrastre.

Panel de blancos (blanco — gen diana)
Blanco — Gen diana
Influenza A — Matrix protein 1 (M1)
Influenza B — Non-structural protein NS-1/2 (NS1/NEP)
Respiratory Syncytial Virus (RSV) — Matrix protein (M)
SARS-CoV-2 — ORF1ab polyprotein and ORF1a polyprotein (ORF1ab / ORF1a)
Adenovirus (especies B, E) — Terminal protein precursor (E2B)
Adenovirus (especie C) — Capsid protein precursor (L3)
Human Metapneumovirus — Matrix protein (M)
Enterovirus / Rhinovirus — 5' untranslated region (5'UTR)
Coronavirus OC43 — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Coronavirus HKU1 — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Coronavirus 229E — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Coronavirus NL63 — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Human Parainfluenza Virus 1 — L polymerase protein (L)
Human Parainfluenza Virus 2 — Large protein (L)
Human Parainfluenza Virus 3 — Nucleocapsid protein (N)
Human Parainfluenza Virus 4 — Large protein (L)

Notas analíticas / operativas

• Utiliza cebadores específicos forward/reverse y sondas marcadas con fluorescencia; la señal de la sonda TAGS requiere escisión por nucleasa y un aumento de la temperatura de reacción para activar la fluorescencia.
• La fluorescencia se captura en múltiples canales y a tres temperaturas definidas por ciclo para permitir la diferenciación multiplex.
• Los controles externos positivos y negativos se procesan de la misma forma que las muestras de pacientes.

Limitaciones

• Los resultados negativos no excluyen la infección respiratoria y no deben usarse como única base para el manejo del paciente.
• Los resultados positivos no excluyen coinfecciones y el agente detectado puede no ser la causa definitiva de la enfermedad.
• No puede distinguir de forma fiable el rinovirus humano del enterovirus debido a la similitud genética.

Beneficios / Destacados

• Flexibilidad para seleccionar dianas y obtener resultados adicionales (reflejo digital) desde el mismo kit/corrida.
• Permite consolidar múltiples dianas respiratorias en una solución personalizable en sistemas existentes de la familia cobas® x800 sin actualizaciones de hardware o software.
• Diseñado para simplificar la logística del laboratorio, reducir pruebas duplicadas y soportar un diagnóstico PCR eficiente con tiempos de respuesta rápidos.

Características / especificaciones técnicas

• Dianas: Influenza A, Influenza B, RSV, SARS-CoV-2, adenovirus (B, C, E), metapneumovirus humano, enterovirus/rinovirus, coronavirus humanos comunes (229E, HKU1, NL63, OC43), parainfluenza 1–4.
• Tipo de muestra: hisopos nasofaríngeos recogidos en Copan UTM-RT® o BD™ Universal Viral Transport (UVT) o equivalente.
• Volumen mínimo de muestra: 0,4 mL.
• Tecnología: PCR en tiempo real con multiplex TAGS de Roche (Temperature Activated Generation of Signal).
• Tamaño del kit: 192 pruebas por kit.
• Estabilidad del kit abierto: 90 días con 40 reutilizaciones.
• Control interno: Control interno de ARN incluido y co-extraído.